El apellido Borja es un apellido de origen español que proviene de la palabra Burgos, que significa ciudad fortificada. Esta palabra se deriva de la palabra latina burgus, que significa castillo. El apellido Borja se asocia con la familia Borja, una familia noble española que se remonta a la Edad Media. Los Borja son descendientes de Rodrigo Borgia, un cardenal español que fue elegido Papa en 1492. Los Borja han tenido una influencia significativa en la historia de España y de América Latina. Los Borja han producido algunos de los líderes más destacados de la región, incluyendo algunos presidentes de Colombia, México y Venezuela. Los Borja también han producido algunos de los artistas más destacados de la región, incluyendo algunos de los más famosos escrit
El primer Borja en llegar a Colombia fue Francisco de Borja y Aragón, quien nació en España en 1510. Tuvo dos hijos, Francisco de Borja y Aragón y Juan de Borja y Aragón. Su profesión era la de militar y gobernador de la Nueva Granada.